El FIT cuenta con cinco estaciones productoras de carga:

• Medias Aguas
• Matías Romero
• Lagunas
• Ixtepec
• Salina Cruz

Se cuenta a lo largo de la línea con cinco patios, ubicados en Medias Aguas, Ver., Matías Romero, Oax., Ixtepec, Oax., Pearson, Oax. y Salina Cruz, Oax. Así como con 18 laderos.